中國科學(xué)院團(tuán)隊研究:華南海鮮市場并非新冠病毒發(fā)源地,11月下旬或已人傳人
來源:中國新聞網(wǎng) 時間:2020-02-22 21:46:14 編輯:田佳平
據(jù)中國科學(xué)院西雙版納熱帶植物園官方網(wǎng)站消息,該園聯(lián)合華南農(nóng)業(yè)大學(xué)和北京腦科中心,收集了全球共享到 GISAID EpiFluTM 數(shù)據(jù)庫中覆蓋四大洲 12 個國家的 93 個新冠病毒樣本基因組數(shù)據(jù) ( 截至 2 月 12 日 ) ,通過全基因組數(shù)據(jù)解析發(fā)現(xiàn):武漢華南海鮮市場的新型冠狀病毒是從其它地方傳入。
93 個樣本包含 58 種單倍型,演化關(guān)系顯示,單倍型 H13 和 H38 是比較"古老的"單倍型,通過一個中間載體 ( mv1,可能是祖先單倍型,也可能是來自中間宿主或"零號病人" ) 與蝙蝠冠狀病毒 RaTG13 關(guān)聯(lián),并通過單倍型 H3 衍生出單倍型 H1。
研究人員稱,與華南海鮮市場有關(guān)聯(lián)的患者樣品單倍型都是 H1 及其衍生單倍型 H2,H8-H12,而一份武漢樣品單倍型 H3 與華南海鮮市場無關(guān)??梢?,華南海鮮市場的新冠病毒是從其它地方傳入,再在市場發(fā)生快速傳播并蔓延。另根據(jù)病患發(fā)病時間記錄和種群擴(kuò)張時間推斷,也印證了華南海鮮市場不是病毒發(fā)源地的推論。
此外,研究人員對 H13 和 H38 的病毒樣品溯源發(fā)現(xiàn),分別來自深圳的病患 ( 廣東首例 ) 和美國華盛頓州的病患 ( 美國首例 ) 。他們的旅行記錄表明都是 2019 年 12 月底至 2020 年 1 月初在武漢被感染?,F(xiàn)有武漢樣本中沒有檢測到 H13 和 H38 單倍型。
研究還顯示,新冠病毒在 2 月 12 日前發(fā)生過 2 次明顯種群擴(kuò)張:一次是 2019 年 12 月 8 日,該結(jié)果暗示病毒可能在 12 月初,甚至 11 月下旬已開始人際傳播,隨后在華南海鮮市場加快;另一次種群擴(kuò)張發(fā)生在 1 月 6 日。
值得一提的是,為細(xì)分來源,研究人員將 58 種單倍型分成五組,包括 3 個古老超級傳播者單倍型 ( H1,H3 和 H13 ) 和 2 個新的超級傳播者單倍型 ( H56 和 mv2 ) 。以此鑒別出廣東的病毒可能有三個來源,重慶和臺灣的病毒有兩個來源。有較多樣本的澳大利亞、法國、日本和美國,患者感染源至少有兩個,尤其是美國包括了五個來源。特別值得關(guān)注的是 H56 這個超級傳播者單倍型,同時是澳大利亞、法國和美國以及中國臺灣患者的傳染源。
研究還表明,新冠病毒基因組沒有發(fā)生重組事件。